DNA甲基化(DNAm)是由遺傳和環(huán)境因素形成的,并受衰老的調(diào)節(jié)?;贒NA甲基化(DNAm)的 "表觀遺傳時(shí)鐘 "已成為一種被廣泛使用的衰老生物標(biāo)志物,其準(zhǔn)確性和實(shí)用性超過(guò)了端粒長(zhǎng)度的測(cè)定。其通常被稱為DNAm年齡(DNAmAge),是基于CpG的生物年齡估計(jì)器,適用于人類和小鼠。所有這些時(shí)鐘都有一個(gè)共同的特點(diǎn)--它們依賴于預(yù)先選擇的CpGs子集的甲基化狀態(tài),這些子集被分配了各自的權(quán)重,并被集體用于估計(jì)年齡。
現(xiàn)有的一個(gè)關(guān)鍵的問(wèn)題是:這些DNAmAge時(shí)鐘檢測(cè)的變化是否純粹是時(shí)間的函數(shù),并完全和年齡相關(guān)?或者,它們是否提供了一種生物衰老的內(nèi)在速度的測(cè)量方法,可以與健康、健身和預(yù)期壽命相關(guān)?
人類流行病學(xué)研究的證據(jù)表明,部分DNAmAge時(shí)鐘檢測(cè)方式在預(yù)測(cè)預(yù)期壽命方面表現(xiàn)良好,相對(duì)于年代年齡而言,較年輕的DNAmAge意味著生物衰老的速度減慢,并與疾病風(fēng)險(xiǎn)降低和壽命延長(zhǎng)有關(guān)。
最近,研究人員在AGING CELL上發(fā)表了一項(xiàng)研究,報(bào)導(dǎo)了表觀遺傳老化、體重(BW)和壽命之間的相互關(guān)系。研究人員發(fā)現(xiàn),在來(lái)自BXD家族的12個(gè)同源品系的小鼠,在壽命上表現(xiàn)出超過(guò)2倍的區(qū)別。
研究人員在70份肝臟標(biāo)本中檢測(cè)了全基因組DNA甲基化水平,這些標(biāo)本主要來(lái)自6-25月齡的雌性小鼠,這些小鼠維持在正常的飼料或高脂飲食(HFD)上。
基于DNA甲基化數(shù)據(jù),研究人員定義了與年齡、年輕時(shí)的體重,以及與飲食相關(guān)的壽命關(guān)聯(lián)的CpG區(qū)域子集。
研究人員發(fā)現(xiàn),這些與年齡相關(guān)的差異甲基化CpG區(qū)域(age-DMRs)具有明顯的基因組特征,DNA甲基化隨時(shí)間的增長(zhǎng)發(fā)生在諸如啟動(dòng)子和外顯子等具有高CpG密度和低平均甲基化的位點(diǎn)。與體重相關(guān)的CpG區(qū)域在內(nèi)含子中富集,在體重較高的小鼠中往往具有較低的甲基化,并與基因表達(dá)成反比(即體重較高的小鼠中mRNA水平較高)。
體重和高脂飲食對(duì)壽命的影響
與壽命相關(guān)的CpG區(qū)域與參與壽命調(diào)控的基因有關(guān),包括端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶基因Tert,該基因在長(zhǎng)壽品系中既有較低的甲基化,又有較高的表達(dá)。
年齡-DMRs定義的表觀遺傳時(shí)鐘顯示,壽命較短品系的小鼠具有加速衰老的特征。較高的體重和高脂飲食都與加速的表觀遺傳學(xué)衰老有關(guān)。
因此,該結(jié)果突出了更大的體重的年齡加速效應(yīng)。此外,研究人員證明,從年齡-DMRs中得出的表觀遺傳老化的測(cè)量方法可以預(yù)測(cè)基因型和飲食引起的雌性BXD成員之間的壽命差異。